Największym sukcesem Smudy na ławce trenerskiej było wprowadzenie Widzewa Łódź do Ligi Mistrzów (w 1996 roku), a także trzykrotne zdobycie mistrzostwa Polski — z Widzewem Łódź (dwa razy) i z Wisłą Kraków (raz).
W latach 2009-2012 Smuda był selekcjonerem reprezentacji Polski, którą poprowadził na Euro 2012. Polska była gospodarzem, nie grała wówczas w eliminacjach, a na Euro nie wyszła z grupy remisując 1:1 z Grecją i Rosją oraz przegrywając 0:1 z Czechami. Występ reprezentacji prowadzonej przez Smudę na Euro 2012 był rozczarowaniem - „polska” grupa była uważana za najsłabszą na Euro i wydawało się, że biało-czerwonym powinno udać się awansować z niej do ćwierćfinału (na Euro grało wówczas 16 drużyn). Po Euro Smuda rozstał się z reprezentacją, a w roli selekcjonera zastąpił go Waldemar Fornalik.
Jakie jeszcze kluby prowadził Franciszek Smuda?
Smuda prowadził też Lecha Poznań (zdobył z nim Puchar Polski w 2009 roku), Górnika Łęczna, Legię Warszawa, Stal Mielec, Odrę Wodzisław Śląski, Zagłębie Lubin. Prowadził też niemiecki Jahn Regensburg (spadł z nim do III ligi) i cypryjski klub Omonia Nikozja.
Smuda uważany jest za jednego z najlepszych polskich trenerów przełomu XIX i XX wieku.